基因检测通过DNA测序以及生物信息大数据分析等技术,用于辅助疾病诊断,也可以用于疾病风险的评估预测等场景。基因检测具有非常重要的战略地位,并已经被列入国家发展战略。对于A企业而言,基因测序是其重要的业务板块。随着基因数据体量和计算需求的增加,快速、准确地进行基因数据分析成为该企业业务增长的关键需求。
面向全集团的综合管理平台
为了建立面向集团的测序生产设备的数据采集、存储、集成、分析、管理的综合平台,促进业务升级,提高用户体验,提升生产效率,国双Gridsum COMPaaS帮助A企业搭建了生产交付信息智能管理平台,方便其促进内外部以工业互联平台为抓手的生态建设,赋能核心业务。具体功能实现包含以下几个方面:
信息采汇:在国内建设统一的、总部层面的信息采汇平台,采集各地实验室仪器的运行状态数据及质控数据;支持多级管理、支持多型号不同设备的接入与管理,并可配置传输数据链;做好数据安全与信息安全保障。
设备分析应用:搭建综合的生产信息采汇平台,对设备综合状态进行深度分析与利用;支持多级数据分析页面的展示,对现场决策提供近实时支撑,对管理人员提供及时预警。
轻应用、微服务、厚平台的总体架构部署
针对所需功能的实现,国双采用“轻应用、微服务、厚平台”的设计理念为A企业生产管理平台进行了总体架构的规划,共分为边缘层、平台层、应用层三部分。边缘层实现数据的采集;平台层以边缘接入平台、通用PaaS平台、工业大数据平台、服务治理平台(可选)和统一运营平台为核心能力,构建可视化组件库,支撑测序生产综合监控、状态分析的智能化分析应用。应用层包括智能监控统计分析、驾驶舱、数据可视化、数据报表和平台管理等五部分功能,对决策层、管理层、执行层等不同层级有不同的权限与访问界面。
系统整体技术架构以灵活支撑测序生产的智能应用为目标,构建了包括基于规则引擎的边缘处理能力、数据采集存储能力、敏捷的数据可视化能力等的技术平台。整个平台可以采集多种不同文件的数据格式,包括txt、html、csv等。此外,采集算子采用边缘计算的k8s特性,可以动态伸缩扩容,增加文件采集量。系统采集到的内容经过解析后可直接写入到生产状态数据库中,最终提供给生产监控、决策支持等相关智能应用。
可拓展的行业落地经验
基于系统的“模式—平台”导向,A企业生产管理平台完成了资源共享、标准管理与简化运维,在实施效果层面实现了模型化、标准化、服务化、复用化。
在经济效益方面,系统极大地减少了人力消耗,维护成本至少减少50%以上,维护效率也得到大幅提升,有效促进了公司资源的合理使用。
A企业生产管理平台覆盖数据采集、上云集成、分析、管理、测序全流程,实现了数据集约化、可视化处理,破除了企业常见的“信息孤岛”、“数据烟囱”等问题。经过A企业、国双双方业务、技术专家互相合作梳理业务层级和数据结构使得数字化转型发展在生命科学—基因测序领域实现了新场景落地,为基因检测行业数字化建设做了生动实践。该平台具有灵活的可拓展性,未来,必定可以更好的服务相关行业及企业在生命科学领域助力多元化业务场景的数字化、智能化转型。
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